Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cass4Q08EC4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cass4Q08EC4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cass4Q08EC4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cass4Q08EC4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cass4Q08EC4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cass4Q08EC4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cass4Q08EC4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cass4Q08EC4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cass4Q08EC4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cass4Q08EC4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cass4Q08EC4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cass4Q08EC4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cass4Q08EC4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cass4Q08EC4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cass4Q08EC4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cass4Q08EC4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cass4Q08EC4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cass4Q08EC4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cass4Q08EC4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cass4Q08EC4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cass4Q08EC4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cass4Q08EC4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cass4Q08EC4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cass4Q08EC4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cass4Q08EC4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cass4Q08EC4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cass4Q08EC4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cass4Q08EC4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cass4Q08EC4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cass4Q08EC4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cass4Q08EC4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cass4Q08EC4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cass4Q08EC4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cass4Q08EC4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cass4Q08EC4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cass4Q08EC4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cass4Q08EC4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cass4Q08EC4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Cass4Q08EC4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cass4Q08EC4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Cass4Q08EC4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cass4Q08EC4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cass4Q08EC4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cass4Q08EC4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cass4Q08EC4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cass4Q08EC4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cass4Q08EC4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cass4Q08EC4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cass4Q08EC4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 756.5 ms