Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Siah2Q06986 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Siah2Q06986 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Siah2Q06986 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Siah2Q06986 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Siah2Q06986 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah2Q06986 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms