Protein–RNA interactions for Protein: Q06666

Srst, Octapeptide-repeat protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrstQ06666 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrstQ06666 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrstQ06666 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SrstQ06666 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrstQ06666 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrstQ06666 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SrstQ06666 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrstQ06666 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SrstQ06666 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrstQ06666 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrstQ06666 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SrstQ06666 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SrstQ06666 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrstQ06666 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrstQ06666 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrstQ06666 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrstQ06666 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SrstQ06666 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrstQ06666 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrstQ06666 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrstQ06666 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrstQ06666 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms