Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox9Q04887 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sox9Q04887 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox9Q04887 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox9Q04887 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sox9Q04887 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Sox9Q04887 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sox9Q04887 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox9Q04887 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox9Q04887 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox9Q04887 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Sox9Q04887 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sox9Q04887 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox9Q04887 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox9Q04887 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sox9Q04887 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox9Q04887 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox9Q04887 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sox9Q04887 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sox9Q04887 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sox9Q04887 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sox9Q04887 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sox9Q04887 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox9Q04887 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox9Q04887 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox9Q04887 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox9Q04887 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sox9Q04887 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox9Q04887 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox9Q04887 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sox9Q04887 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sox9Q04887 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox9Q04887 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox9Q04887 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox9Q04887 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sox9Q04887 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sox9Q04887 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox9Q04887 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sox9Q04887 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox9Q04887 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox9Q04887 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox9Q04887 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox9Q04887 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox9Q04887 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sox9Q04887 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox9Q04887 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox9Q04887 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sox9Q04887 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sox9Q04887 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sox9Q04887 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sox9Q04887 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox9Q04887 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox9Q04887 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sox9Q04887 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox9Q04887 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sox9Q04887 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox9Q04887 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sox9Q04887 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sox9Q04887 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Sox9Q04887 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox9Q04887 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox9Q04887 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox9Q04887 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox9Q04887 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox9Q04887 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sox9Q04887 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sox9Q04887 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox9Q04887 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox9Q04887 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox9Q04887 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox9Q04887 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox9Q04887 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox9Q04887 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Sox9Q04887 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sox9Q04887 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox9Q04887 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox9Q04887 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sox9Q04887 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox9Q04887 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sox9Q04887 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sox9Q04887 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Sox9Q04887 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sox9Q04887 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox9Q04887 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sox9Q04887 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox9Q04887 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox9Q04887 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox9Q04887 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sox9Q04887 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox9Q04887 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox9Q04887 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sox9Q04887 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox9Q04887 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox9Q04887 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox9Q04887 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sox9Q04887 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sox9Q04887 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms