Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smpd1Q04519 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Smpd1Q04519 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Smpd1Q04519 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smpd1Q04519 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smpd1Q04519 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Smpd1Q04519 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smpd1Q04519 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Smpd1Q04519 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smpd1Q04519 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smpd1Q04519 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Smpd1Q04519 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Smpd1Q04519 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Smpd1Q04519 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smpd1Q04519 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Smpd1Q04519 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smpd1Q04519 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Smpd1Q04519 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smpd1Q04519 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Smpd1Q04519 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smpd1Q04519 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Smpd1Q04519 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Smpd1Q04519 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smpd1Q04519 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Smpd1Q04519 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Smpd1Q04519 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Smpd1Q04519 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Smpd1Q04519 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smpd1Q04519 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Smpd1Q04519 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Smpd1Q04519 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smpd1Q04519 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smpd1Q04519 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Smpd1Q04519 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Smpd1Q04519 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smpd1Q04519 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Smpd1Q04519 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Smpd1Q04519 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Smpd1Q04519 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smpd1Q04519 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Smpd1Q04519 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smpd1Q04519 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smpd1Q04519 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Smpd1Q04519 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smpd1Q04519 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Smpd1Q04519 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smpd1Q04519 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smpd1Q04519 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smpd1Q04519 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smpd1Q04519 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smpd1Q04519 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Smpd1Q04519 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Smpd1Q04519 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Smpd1Q04519 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Smpd1Q04519 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Smpd1Q04519 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Smpd1Q04519 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Smpd1Q04519 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smpd1Q04519 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Smpd1Q04519 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smpd1Q04519 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smpd1Q04519 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smpd1Q04519 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Smpd1Q04519 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smpd1Q04519 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Smpd1Q04519 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Smpd1Q04519 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms