Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccl7Q03366 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccl7Q03366 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccl7Q03366 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccl7Q03366 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccl7Q03366 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccl7Q03366 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccl7Q03366 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccl7Q03366 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ccl7Q03366 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccl7Q03366 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccl7Q03366 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccl7Q03366 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl7Q03366 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl7Q03366 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl7Q03366 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl7Q03366 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccl7Q03366 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl7Q03366 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl7Q03366 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl7Q03366 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccl7Q03366 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccl7Q03366 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccl7Q03366 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccl7Q03366 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccl7Q03366 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccl7Q03366 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccl7Q03366 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccl7Q03366 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccl7Q03366 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl7Q03366 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl7Q03366 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccl7Q03366 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccl7Q03366 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccl7Q03366 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccl7Q03366 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccl7Q03366 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ccl7Q03366 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccl7Q03366 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccl7Q03366 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms