Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pax5Q02650 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pax5Q02650 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pax5Q02650 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pax5Q02650 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pax5Q02650 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pax5Q02650 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Pax5Q02650 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pax5Q02650 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Pax5Q02650 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pax5Q02650 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pax5Q02650 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pax5Q02650 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Pax5Q02650 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pax5Q02650 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pax5Q02650 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pax5Q02650 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pax5Q02650 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pax5Q02650 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax5Q02650 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax5Q02650 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pax5Q02650 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pax5Q02650 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pax5Q02650 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pax5Q02650 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax5Q02650 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax5Q02650 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax5Q02650 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pax5Q02650 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pax5Q02650 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pax5Q02650 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pax5Q02650 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms