Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htr1fQ02284 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htr1fQ02284 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Htr1fQ02284 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Htr1fQ02284 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Htr1fQ02284 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Htr1fQ02284 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htr1fQ02284 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htr1fQ02284 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Htr1fQ02284 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Htr1fQ02284 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Htr1fQ02284 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htr1fQ02284 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Htr1fQ02284 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htr1fQ02284 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htr1fQ02284 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htr1fQ02284 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htr1fQ02284 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htr1fQ02284 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Htr1fQ02284 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Htr1fQ02284 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Htr1fQ02284 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Htr1fQ02284 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Htr1fQ02284 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Htr1fQ02284 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Htr1fQ02284 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Htr1fQ02284 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Htr1fQ02284 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Htr1fQ02284 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Htr1fQ02284 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Htr1fQ02284 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Htr1fQ02284 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htr1fQ02284 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htr1fQ02284 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Htr1fQ02284 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htr1fQ02284 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Htr1fQ02284 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Htr1fQ02284 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Htr1fQ02284 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htr1fQ02284 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Htr1fQ02284 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htr1fQ02284 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htr1fQ02284 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Htr1fQ02284 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htr1fQ02284 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htr1fQ02284 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Htr1fQ02284 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Htr1fQ02284 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.2 ms