Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrkcqQ02111 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PrkcqQ02111 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrkcqQ02111 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkcqQ02111 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkcqQ02111 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrkcqQ02111 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrkcqQ02111 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrkcqQ02111 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrkcqQ02111 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrkcqQ02111 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrkcqQ02111 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrkcqQ02111 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrkcqQ02111 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrkcqQ02111 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcqQ02111 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcqQ02111 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcqQ02111 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcqQ02111 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcqQ02111 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PrkcqQ02111 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrkcqQ02111 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrkcqQ02111 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrkcqQ02111 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrkcqQ02111 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrkcqQ02111 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PrkcqQ02111 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcqQ02111 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PrkcqQ02111 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcqQ02111 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcqQ02111 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PrkcqQ02111 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkcqQ02111 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PrkcqQ02111 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkcqQ02111 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkcqQ02111 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkcqQ02111 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkcqQ02111 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkcqQ02111 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PrkcqQ02111 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkcqQ02111 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkcqQ02111 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PrkcqQ02111 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcqQ02111 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcqQ02111 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PrkcqQ02111 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrkcqQ02111 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PrkcqQ02111 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcqQ02111 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcqQ02111 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PrkcqQ02111 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcqQ02111 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PrkcqQ02111 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PrkcqQ02111 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PrkcqQ02111 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PrkcqQ02111 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PrkcqQ02111 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkcqQ02111 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PrkcqQ02111 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkcqQ02111 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkcqQ02111 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PrkcqQ02111 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms