Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde1bQ01065 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde1bQ01065 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pde1bQ01065 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pde1bQ01065 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde1bQ01065 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde1bQ01065 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde1bQ01065 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde1bQ01065 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pde1bQ01065 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde1bQ01065 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pde1bQ01065 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pde1bQ01065 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pde1bQ01065 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde1bQ01065 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pde1bQ01065 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde1bQ01065 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde1bQ01065 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pde1bQ01065 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde1bQ01065 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pde1bQ01065 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pde1bQ01065 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pde1bQ01065 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde1bQ01065 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde1bQ01065 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde1bQ01065 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde1bQ01065 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pde1bQ01065 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde1bQ01065 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pde1bQ01065 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pde1bQ01065 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde1bQ01065 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pde1bQ01065 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Pde1bQ01065 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pde1bQ01065 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde1bQ01065 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde1bQ01065 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde1bQ01065 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pde1bQ01065 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde1bQ01065 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde1bQ01065 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pde1bQ01065 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde1bQ01065 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pde1bQ01065 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pde1bQ01065 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pde1bQ01065 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde1bQ01065 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pde1bQ01065 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde1bQ01065 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pde1bQ01065 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde1bQ01065 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde1bQ01065 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde1bQ01065 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde1bQ01065 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde1bQ01065 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde1bQ01065 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde1bQ01065 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde1bQ01065 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde1bQ01065 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde1bQ01065 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde1bQ01065 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde1bQ01065 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde1bQ01065 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde1bQ01065 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde1bQ01065 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde1bQ01065 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde1bQ01065 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms