Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Itga4Q00651 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Itga4Q00651 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itga4Q00651 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Itga4Q00651 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Itga4Q00651 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga4Q00651 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Itga4Q00651 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Itga4Q00651 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Itga4Q00651 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Itga4Q00651 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itga4Q00651 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itga4Q00651 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Itga4Q00651 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga4Q00651 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga4Q00651 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Itga4Q00651 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga4Q00651 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga4Q00651 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itga4Q00651 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itga4Q00651 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itga4Q00651 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Itga4Q00651 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itga4Q00651 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Itga4Q00651 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itga4Q00651 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itga4Q00651 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga4Q00651 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itga4Q00651 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Itga4Q00651 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itga4Q00651 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itga4Q00651 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Itga4Q00651 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itga4Q00651 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itga4Q00651 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Itga4Q00651 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga4Q00651 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga4Q00651 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itga4Q00651 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itga4Q00651 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itga4Q00651 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itga4Q00651 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga4Q00651 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itga4Q00651 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itga4Q00651 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itga4Q00651 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga4Q00651 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga4Q00651 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itga4Q00651 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga4Q00651 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga4Q00651 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itga4Q00651 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itga4Q00651 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Itga4Q00651 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms