Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pax8Q00288 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pax8Q00288 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pax8Q00288 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Pax8Q00288 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pax8Q00288 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pax8Q00288 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pax8Q00288 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Pax8Q00288 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Pax8Q00288 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pax8Q00288 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Pax8Q00288 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pax8Q00288 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pax8Q00288 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Pax8Q00288 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pax8Q00288 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Pax8Q00288 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pax8Q00288 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pax8Q00288 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Pax8Q00288 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pax8Q00288 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Pax8Q00288 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pax8Q00288 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Pax8Q00288 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Pax8Q00288 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pax8Q00288 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Pax8Q00288 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Pax8Q00288 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pax8Q00288 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pax8Q00288 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Pax8Q00288 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Pax8Q00288 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pax8Q00288 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Pax8Q00288 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pax8Q00288 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pax8Q00288 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Pax8Q00288 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pax8Q00288 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pax8Q00288 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pax8Q00288 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pax8Q00288 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pax8Q00288 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pax8Q00288 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms