Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp10Q000W5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbp10Q000W5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp10Q000W5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbp10Q000W5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp10Q000W5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbp10Q000W5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbp10Q000W5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp10Q000W5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp10Q000W5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp10Q000W5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp10Q000W5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbp10Q000W5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp10Q000W5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp10Q000W5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbp10Q000W5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp10Q000W5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbp10Q000W5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp10Q000W5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbp10Q000W5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gbp10Q000W5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp10Q000W5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp10Q000W5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp10Q000W5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp10Q000W5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp10Q000W5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp10Q000W5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp10Q000W5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp10Q000W5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp10Q000W5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp10Q000W5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbp10Q000W5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbp10Q000W5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp10Q000W5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp10Q000W5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp10Q000W5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp10Q000W5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp10Q000W5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Gbp10Q000W5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp10Q000W5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp10Q000W5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp10Q000W5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp10Q000W5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp10Q000W5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp10Q000W5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms