Protein–RNA interactions for Protein: P97797

Sirpa, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type substrate 1, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SirpaP97797 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SirpaP97797 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SirpaP97797 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SirpaP97797 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SirpaP97797 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SirpaP97797 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SirpaP97797 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SirpaP97797 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SirpaP97797 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SirpaP97797 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SirpaP97797 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SirpaP97797 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SirpaP97797 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SirpaP97797 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SirpaP97797 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SirpaP97797 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SirpaP97797 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SirpaP97797 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SirpaP97797 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SirpaP97797 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SirpaP97797 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SirpaP97797 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SirpaP97797 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SirpaP97797 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SirpaP97797 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SirpaP97797 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SirpaP97797 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SirpaP97797 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SirpaP97797 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SirpaP97797 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SirpaP97797 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SirpaP97797 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SirpaP97797 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SirpaP97797 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SirpaP97797 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SirpaP97797 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SirpaP97797 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SirpaP97797 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SirpaP97797 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SirpaP97797 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SirpaP97797 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SirpaP97797 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SirpaP97797 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SirpaP97797 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SirpaP97797 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SirpaP97797 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SirpaP97797 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SirpaP97797 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SirpaP97797 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SirpaP97797 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SirpaP97797 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SirpaP97797 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SirpaP97797 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SirpaP97797 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SirpaP97797 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SirpaP97797 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SirpaP97797 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SirpaP97797 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SirpaP97797 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SirpaP97797 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SirpaP97797 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SirpaP97797 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SirpaP97797 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SirpaP97797 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SirpaP97797 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SirpaP97797 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SirpaP97797 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms