Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmklr1P97468 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cmklr1P97468 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmklr1P97468 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmklr1P97468 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmklr1P97468 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmklr1P97468 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmklr1P97468 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmklr1P97468 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmklr1P97468 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cmklr1P97468 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmklr1P97468 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmklr1P97468 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmklr1P97468 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmklr1P97468 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cmklr1P97468 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cmklr1P97468 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cmklr1P97468 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cmklr1P97468 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmklr1P97468 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmklr1P97468 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmklr1P97468 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmklr1P97468 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmklr1P97468 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cmklr1P97468 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmklr1P97468 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cmklr1P97468 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmklr1P97468 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cmklr1P97468 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmklr1P97468 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmklr1P97468 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmklr1P97468 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmklr1P97468 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cmklr1P97468 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmklr1P97468 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmklr1P97468 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmklr1P97468 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmklr1P97468 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmklr1P97468 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmklr1P97468 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmklr1P97468 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmklr1P97468 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmklr1P97468 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmklr1P97468 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmklr1P97468 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmklr1P97468 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms