Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RhodP97348 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RhodP97348 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RhodP97348 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RhodP97348 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RhodP97348 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RhodP97348 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RhodP97348 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RhodP97348 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RhodP97348 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RhodP97348 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RhodP97348 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RhodP97348 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RhodP97348 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RhodP97348 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RhodP97348 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RhodP97348 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RhodP97348 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RhodP97348 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RhodP97348 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RhodP97348 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RhodP97348 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RhodP97348 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RhodP97348 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RhodP97348 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhodP97348 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RhodP97348 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RhodP97348 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhodP97348 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RhodP97348 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RhodP97348 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RhodP97348 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhodP97348 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RhodP97348 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RhodP97348 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RhodP97348 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhodP97348 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhodP97348 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RhodP97348 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhodP97348 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhodP97348 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhodP97348 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhodP97348 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RhodP97348 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhodP97348 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhodP97348 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RhodP97348 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhodP97348 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhodP97348 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RhodP97348 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
RhodP97348 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RhodP97348 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RhodP97348 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RhodP97348 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RhodP97348 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RhodP97348 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhodP97348 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhodP97348 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RhodP97348 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RhodP97348 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RhodP97348 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
RhodP97348 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RhodP97348 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RhodP97348 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhodP97348 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhodP97348 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhodP97348 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhodP97348 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RhodP97348 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhodP97348 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RhodP97348 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RhodP97348 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RhodP97348 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RhodP97348 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RhodP97348 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RhodP97348 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RhodP97348 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RhodP97348 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RhodP97348 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RhodP97348 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RhodP97348 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RhodP97348 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RhodP97348 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RhodP97348 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RhodP97348 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RhodP97348 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RhodP97348 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RhodP97348 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhodP97348 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhodP97348 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RhodP97348 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RhodP97348 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RhodP97348 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RhodP97348 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RhodP97348 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RhodP97348 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RhodP97348 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhodP97348 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhodP97348 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RhodP97348 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms