Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim43bP86448 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim43bP86448 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim43bP86448 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim43bP86448 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trim43bP86448 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Trim43bP86448 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim43bP86448 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim43bP86448 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim43bP86448 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim43bP86448 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim43bP86448 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim43bP86448 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim43bP86448 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim43bP86448 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim43bP86448 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim43bP86448 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim43bP86448 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim43bP86448 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim43bP86448 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim43bP86448 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim43bP86448 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim43bP86448 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim43bP86448 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim43bP86448 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim43bP86448 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim43bP86448 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim43bP86448 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim43bP86448 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim43bP86448 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim43bP86448 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim43bP86448 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim43bP86448 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim43bP86448 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim43bP86448 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim43bP86448 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim43bP86448 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim43bP86448 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim43bP86448 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim43bP86448 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim43bP86448 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim43bP86448 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim43bP86448 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim43bP86448 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim43bP86448 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms