Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gabpb2P81069 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gabpb2P81069 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gabpb2P81069 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gabpb2P81069 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gabpb2P81069 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gabpb2P81069 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gabpb2P81069 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gabpb2P81069 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gabpb2P81069 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gabpb2P81069 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gabpb2P81069 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gabpb2P81069 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gabpb2P81069 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gabpb2P81069 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gabpb2P81069 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gabpb2P81069 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Gabpb2P81069 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gabpb2P81069 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gabpb2P81069 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gabpb2P81069 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gabpb2P81069 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gabpb2P81069 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gabpb2P81069 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gabpb2P81069 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gabpb2P81069 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gabpb2P81069 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Gabpb2P81069 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Gabpb2P81069 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms