Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Atp8a1P70704 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp8a1P70704 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atp8a1P70704 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp8a1P70704 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp8a1P70704 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atp8a1P70704 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp8a1P70704 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp8a1P70704 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp8a1P70704 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp8a1P70704 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Atp8a1P70704 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp8a1P70704 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atp8a1P70704 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8a1P70704 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atp8a1P70704 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp8a1P70704 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atp8a1P70704 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp8a1P70704 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atp8a1P70704 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp8a1P70704 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp8a1P70704 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp8a1P70704 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp8a1P70704 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atp8a1P70704 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp8a1P70704 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp8a1P70704 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atp8a1P70704 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp8a1P70704 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp8a1P70704 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atp8a1P70704 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atp8a1P70704 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atp8a1P70704 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Atp8a1P70704 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp8a1P70704 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms