Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ErfP70459 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ErfP70459 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ErfP70459 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ErfP70459 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ErfP70459 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ErfP70459 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ErfP70459 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ErfP70459 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ErfP70459 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ErfP70459 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ErfP70459 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ErfP70459 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ErfP70459 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ErfP70459 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ErfP70459 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ErfP70459 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ErfP70459 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ErfP70459 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ErfP70459 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ErfP70459 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ErfP70459 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ErfP70459 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ErfP70459 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ErfP70459 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ErfP70459 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ErfP70459 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ErfP70459 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ErfP70459 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ErfP70459 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ErfP70459 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ErfP70459 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ErfP70459 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ErfP70459 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ErfP70459 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ErfP70459 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ErfP70459 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ErfP70459 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ErfP70459 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ErfP70459 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ErfP70459 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ErfP70459 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ErfP70459 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ErfP70459 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ErfP70459 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ErfP70459 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ErfP70459 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ErfP70459 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ErfP70459 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ErfP70459 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ErfP70459 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ErfP70459 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ErfP70459 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ErfP70459 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ErfP70459 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ErfP70459 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ErfP70459 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ErfP70459 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ErfP70459 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ErfP70459 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ErfP70459 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ErfP70459 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ErfP70459 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ErfP70459 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ErfP70459 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ErfP70459 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ErfP70459 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ErfP70459 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ErfP70459 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ErfP70459 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ErfP70459 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ErfP70459 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ErfP70459 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ErfP70459 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ErfP70459 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ErfP70459 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ErfP70459 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ErfP70459 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ErfP70459 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ErfP70459 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ErfP70459 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ErfP70459 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ErfP70459 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ErfP70459 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ErfP70459 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ErfP70459 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ErfP70459 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ErfP70459 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ErfP70459 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ErfP70459 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ErfP70459 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ErfP70459 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ErfP70459 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ErfP70459 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ErfP70459 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ErfP70459 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ErfP70459 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ErfP70459 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ErfP70459 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ErfP70459 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms