Protein–RNA interactions for Protein: P70279

Surf6, Surfeit locus protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf6P70279 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Surf6P70279 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Surf6P70279 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Surf6P70279 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Surf6P70279 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Surf6P70279 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Surf6P70279 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Surf6P70279 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Surf6P70279 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Surf6P70279 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Surf6P70279 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Surf6P70279 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Surf6P70279 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Surf6P70279 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Surf6P70279 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Surf6P70279 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Surf6P70279 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Surf6P70279 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Surf6P70279 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Surf6P70279 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Surf6P70279 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Surf6P70279 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Surf6P70279 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Surf6P70279 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Surf6P70279 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Surf6P70279 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Surf6P70279 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Surf6P70279 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Surf6P70279 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Surf6P70279 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Surf6P70279 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Surf6P70279 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Surf6P70279 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Surf6P70279 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Surf6P70279 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Surf6P70279 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Surf6P70279 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Surf6P70279 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Surf6P70279 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Surf6P70279 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Surf6P70279 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Surf6P70279 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Surf6P70279 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Surf6P70279 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Surf6P70279 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Surf6P70279 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Surf6P70279 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Surf6P70279 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Surf6P70279 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Surf6P70279 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Surf6P70279 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Surf6P70279 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Surf6P70279 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Surf6P70279 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Surf6P70279 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Surf6P70279 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Surf6P70279 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Surf6P70279 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Surf6P70279 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Surf6P70279 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Surf6P70279 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Surf6P70279 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Surf6P70279 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms