Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Acta1P68134 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Acta1P68134 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Acta1P68134 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Acta1P68134 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Acta1P68134 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Acta1P68134 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acta1P68134 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acta1P68134 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acta1P68134 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acta1P68134 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Acta1P68134 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acta1P68134 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acta1P68134 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acta1P68134 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Acta1P68134 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Acta1P68134 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acta1P68134 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Acta1P68134 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acta1P68134 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acta1P68134 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acta1P68134 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acta1P68134 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acta1P68134 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acta1P68134 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acta1P68134 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acta1P68134 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acta1P68134 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acta1P68134 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acta1P68134 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Acta1P68134 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms