Protein–RNA interactions for Protein: P62830

Rpl23, 60S ribosomal protein L23, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl23P62830 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rpl23P62830 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rpl23P62830 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rpl23P62830 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl23P62830 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpl23P62830 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl23P62830 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms