Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Acta2P62737 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acta2P62737 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Acta2P62737 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acta2P62737 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acta2P62737 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acta2P62737 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Acta2P62737 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acta2P62737 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acta2P62737 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Acta2P62737 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Acta2P62737 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Acta2P62737 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Acta2P62737 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acta2P62737 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acta2P62737 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Acta2P62737 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Acta2P62737 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Acta2P62737 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acta2P62737 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acta2P62737 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acta2P62737 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acta2P62737 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acta2P62737 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acta2P62737 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acta2P62737 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Acta2P62737 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acta2P62737 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acta2P62737 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acta2P62737 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acta2P62737 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acta2P62737 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms