Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpd2P62317 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpd2P62317 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpd2P62317 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpd2P62317 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Snrpd2P62317 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpd2P62317 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpd2P62317 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpd2P62317 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Snrpd2P62317 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpd2P62317 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpd2P62317 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpd2P62317 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Snrpd2P62317 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpd2P62317 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Snrpd2P62317 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snrpd2P62317 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpd2P62317 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpd2P62317 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpd2P62317 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snrpd2P62317 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrpd2P62317 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snrpd2P62317 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpd2P62317 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpd2P62317 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snrpd2P62317 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpd2P62317 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpd2P62317 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpd2P62317 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snrpd2P62317 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snrpd2P62317 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snrpd2P62317 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Snrpd2P62317 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Snrpd2P62317 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Snrpd2P62317 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpd2P62317 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpd2P62317 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpd2P62317 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpd2P62317 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Snrpd2P62317 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpd2P62317 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpd2P62317 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Snrpd2P62317 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms