Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Usp46P62069 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Usp46P62069 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp46P62069 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp46P62069 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Usp46P62069 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp46P62069 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp46P62069 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp46P62069 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp46P62069 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp46P62069 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp46P62069 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp46P62069 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Usp46P62069 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Usp46P62069 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp46P62069 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Usp46P62069 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp46P62069 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp46P62069 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Usp46P62069 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp46P62069 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Usp46P62069 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Usp46P62069 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp46P62069 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Usp46P62069 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp46P62069 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp46P62069 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp46P62069 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Usp46P62069 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp46P62069 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp46P62069 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp46P62069 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp46P62069 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms