Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Smg6P61406 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smg6P61406 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Smg6P61406 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Smg6P61406 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Smg6P61406 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Smg6P61406 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Smg6P61406 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Smg6P61406 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Smg6P61406 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Smg6P61406 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Smg6P61406 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Smg6P61406 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smg6P61406 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smg6P61406 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Smg6P61406 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Smg6P61406 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Smg6P61406 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Smg6P61406 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Smg6P61406 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Smg6P61406 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Smg6P61406 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Smg6P61406 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Smg6P61406 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Smg6P61406 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Smg6P61406 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Smg6P61406 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Smg6P61406 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Smg6P61406 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Smg6P61406 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Smg6P61406 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Smg6P61406 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Smg6P61406 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Smg6P61406 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Smg6P61406 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Smg6P61406 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smg6P61406 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Smg6P61406 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Smg6P61406 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Smg6P61406 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Smg6P61406 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Smg6P61406 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Smg6P61406 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Smg6P61406 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Smg6P61406 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smg6P61406 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Smg6P61406 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Smg6P61406 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Smg6P61406 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Smg6P61406 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Smg6P61406 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Smg6P61406 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Smg6P61406 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smg6P61406 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Smg6P61406 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Smg6P61406 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Smg6P61406 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Smg6P61406 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Smg6P61406 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Smg6P61406 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Smg6P61406 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Smg6P61406 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Smg6P61406 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Smg6P61406 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Smg6P61406 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Smg6P61406 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Smg6P61406 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Smg6P61406 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Smg6P61406 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Smg6P61406 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Smg6P61406 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Smg6P61406 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Smg6P61406 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Smg6P61406 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Smg6P61406 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Smg6P61406 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Smg6P61406 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Smg6P61406 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Smg6P61406 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Smg6P61406 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Smg6P61406 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Smg6P61406 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Smg6P61406 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Smg6P61406 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Smg6P61406 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
Smg6P61406 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Smg6P61406 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Smg6P61406 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smg6P61406 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smg6P61406 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Smg6P61406 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Smg6P61406 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smg6P61406 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smg6P61406 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Smg6P61406 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Smg6P61406 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Smg6P61406 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Smg6P61406 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Smg6P61406 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Smg6P61406 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms