Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rims4P60191 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rims4P60191 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rims4P60191 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rims4P60191 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rims4P60191 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rims4P60191 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rims4P60191 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rims4P60191 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rims4P60191 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rims4P60191 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rims4P60191 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rims4P60191 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rims4P60191 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rims4P60191 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rims4P60191 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rims4P60191 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rims4P60191 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rims4P60191 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rims4P60191 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rims4P60191 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rims4P60191 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rims4P60191 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rims4P60191 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rims4P60191 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rims4P60191 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rims4P60191 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rims4P60191 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rims4P60191 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rims4P60191 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rims4P60191 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rims4P60191 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rims4P60191 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rims4P60191 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Rims4P60191 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rims4P60191 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rims4P60191 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rims4P60191 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rims4P60191 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rims4P60191 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rims4P60191 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rims4P60191 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rims4P60191 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rims4P60191 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rims4P60191 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rims4P60191 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rims4P60191 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rims4P60191 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rims4P60191 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rims4P60191 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms