Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Pcmtd1P59913 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pcmtd1P59913 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Pcmtd1P59913 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Pcmtd1P59913 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcmtd1P59913 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcmtd1P59913 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcmtd1P59913 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Pcmtd1P59913 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcmtd1P59913 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcmtd1P59913 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcmtd1P59913 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Pcmtd1P59913 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Pcmtd1P59913 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Pcmtd1P59913 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcmtd1P59913 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcmtd1P59913 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Pcmtd1P59913 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcmtd1P59913 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcmtd1P59913 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pcmtd1P59913 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcmtd1P59913 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcmtd1P59913 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcmtd1P59913 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pcmtd1P59913 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pcmtd1P59913 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pcmtd1P59913 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pcmtd1P59913 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcmtd1P59913 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcmtd1P59913 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcmtd1P59913 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Pcmtd1P59913 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcmtd1P59913 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcmtd1P59913 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pcmtd1P59913 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcmtd1P59913 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcmtd1P59913 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcmtd1P59913 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pcmtd1P59913 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Pcmtd1P59913 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcmtd1P59913 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcmtd1P59913 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcmtd1P59913 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcmtd1P59913 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcmtd1P59913 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pcmtd1P59913 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pcmtd1P59913 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcmtd1P59913 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcmtd1P59913 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcmtd1P59913 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pcmtd1P59913 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcmtd1P59913 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcmtd1P59913 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcmtd1P59913 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pcmtd1P59913 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pcmtd1P59913 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pcmtd1P59913 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pcmtd1P59913 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pcmtd1P59913 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pcmtd1P59913 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcmtd1P59913 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcmtd1P59913 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pcmtd1P59913 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Pcmtd1P59913 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcmtd1P59913 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pcmtd1P59913 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Pcmtd1P59913 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pcmtd1P59913 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcmtd1P59913 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcmtd1P59913 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pcmtd1P59913 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pcmtd1P59913 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcmtd1P59913 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pcmtd1P59913 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcmtd1P59913 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Pcmtd1P59913 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcmtd1P59913 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcmtd1P59913 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcmtd1P59913 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcmtd1P59913 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pcmtd1P59913 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.3 ms