Protein–RNA interactions for Protein: P59672

Anks1a, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks1aP59672 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Anks1aP59672 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Anks1aP59672 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Anks1aP59672 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Anks1aP59672 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Anks1aP59672 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Anks1aP59672 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Anks1aP59672 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Anks1aP59672 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Anks1aP59672 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Anks1aP59672 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Anks1aP59672 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Anks1aP59672 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Anks1aP59672 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Anks1aP59672 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Anks1aP59672 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Anks1aP59672 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Anks1aP59672 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Anks1aP59672 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Anks1aP59672 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Anks1aP59672 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Anks1aP59672 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Anks1aP59672 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Anks1aP59672 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Anks1aP59672 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Anks1aP59672 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Anks1aP59672 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Anks1aP59672 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Anks1aP59672 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Anks1aP59672 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Anks1aP59672 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Anks1aP59672 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Anks1aP59672 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Anks1aP59672 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Anks1aP59672 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Anks1aP59672 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Anks1aP59672 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms