Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrn4P59383 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrn4P59383 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrn4P59383 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrn4P59383 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrn4P59383 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrn4P59383 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrn4P59383 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrn4P59383 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Lrrn4P59383 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrn4P59383 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrn4P59383 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrn4P59383 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrn4P59383 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrn4P59383 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrn4P59383 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrn4P59383 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrn4P59383 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrn4P59383 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrn4P59383 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrn4P59383 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrn4P59383 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrn4P59383 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrn4P59383 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrn4P59383 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrn4P59383 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrrn4P59383 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrrn4P59383 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrn4P59383 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrrn4P59383 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrn4P59383 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrrn4P59383 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrn4P59383 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrn4P59383 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrrn4P59383 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrn4P59383 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrn4P59383 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrn4P59383 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrrn4P59383 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lrrn4P59383 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms