Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Csrnp3P59055 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Csrnp3P59055 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Csrnp3P59055 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Csrnp3P59055 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Csrnp3P59055 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Csrnp3P59055 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Csrnp3P59055 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Csrnp3P59055 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Csrnp3P59055 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Csrnp3P59055 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Csrnp3P59055 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Csrnp3P59055 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Csrnp3P59055 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Csrnp3P59055 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Csrnp3P59055 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Csrnp3P59055 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Csrnp3P59055 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Csrnp3P59055 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Csrnp3P59055 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Csrnp3P59055 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Csrnp3P59055 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Csrnp3P59055 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Csrnp3P59055 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Csrnp3P59055 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Csrnp3P59055 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Csrnp3P59055 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Csrnp3P59055 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Csrnp3P59055 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Csrnp3P59055 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Csrnp3P59055 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Csrnp3P59055 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Csrnp3P59055 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Csrnp3P59055 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Csrnp3P59055 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Csrnp3P59055 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Csrnp3P59055 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Csrnp3P59055 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Csrnp3P59055 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Csrnp3P59055 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Csrnp3P59055 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Csrnp3P59055 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Csrnp3P59055 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Csrnp3P59055 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Csrnp3P59055 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Csrnp3P59055 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Csrnp3P59055 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Csrnp3P59055 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Csrnp3P59055 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Csrnp3P59055 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Csrnp3P59055 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Csrnp3P59055 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Csrnp3P59055 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Csrnp3P59055 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Csrnp3P59055 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Csrnp3P59055 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Csrnp3P59055 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Csrnp3P59055 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Csrnp3P59055 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Csrnp3P59055 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Csrnp3P59055 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Csrnp3P59055 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Csrnp3P59055 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Csrnp3P59055 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Csrnp3P59055 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Csrnp3P59055 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms