Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dpf3P58269 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dpf3P58269 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Dpf3P58269 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dpf3P58269 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Dpf3P58269 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Dpf3P58269 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dpf3P58269 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Dpf3P58269 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dpf3P58269 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dpf3P58269 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dpf3P58269 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dpf3P58269 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dpf3P58269 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Dpf3P58269 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Dpf3P58269 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dpf3P58269 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Dpf3P58269 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Dpf3P58269 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dpf3P58269 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dpf3P58269 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Dpf3P58269 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dpf3P58269 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Dpf3P58269 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Dpf3P58269 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dpf3P58269 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dpf3P58269 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dpf3P58269 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Dpf3P58269 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dpf3P58269 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dpf3P58269 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Dpf3P58269 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dpf3P58269 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Dpf3P58269 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Dpf3P58269 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Dpf3P58269 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Dpf3P58269 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dpf3P58269 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dpf3P58269 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Dpf3P58269 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Dpf3P58269 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dpf3P58269 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dpf3P58269 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dpf3P58269 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dpf3P58269 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dpf3P58269 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dpf3P58269 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Dpf3P58269 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Dpf3P58269 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dpf3P58269 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dpf3P58269 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dpf3P58269 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dpf3P58269 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dpf3P58269 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Dpf3P58269 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dpf3P58269 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Dpf3P58269 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dpf3P58269 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dpf3P58269 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dpf3P58269 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dpf3P58269 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dpf3P58269 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dpf3P58269 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dpf3P58269 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dpf3P58269 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dpf3P58269 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dpf3P58269 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Dpf3P58269 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dpf3P58269 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dpf3P58269 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Dpf3P58269 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Dpf3P58269 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.6 ms