Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Snrpa1P57784 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Snrpa1P57784 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Snrpa1P57784 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Snrpa1P57784 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Snrpa1P57784 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Snrpa1P57784 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Snrpa1P57784 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
Snrpa1P57784 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Snrpa1P57784 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Snrpa1P57784 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Snrpa1P57784 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Snrpa1P57784 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Snrpa1P57784 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Snrpa1P57784 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Snrpa1P57784 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Snrpa1P57784 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Snrpa1P57784 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Snrpa1P57784 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Snrpa1P57784 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Snrpa1P57784 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Snrpa1P57784 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Snrpa1P57784 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Snrpa1P57784 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
Snrpa1P57784 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Snrpa1P57784 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Snrpa1P57784 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Snrpa1P57784 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Snrpa1P57784 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Snrpa1P57784 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Snrpa1P57784 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Snrpa1P57784 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Snrpa1P57784 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Snrpa1P57784 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Snrpa1P57784 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Snrpa1P57784 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Snrpa1P57784 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Snrpa1P57784 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Snrpa1P57784 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Snrpa1P57784 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Snrpa1P57784 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Snrpa1P57784 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Snrpa1P57784 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Snrpa1P57784 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Snrpa1P57784 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Snrpa1P57784 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Snrpa1P57784 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Snrpa1P57784 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Snrpa1P57784 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Snrpa1P57784 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Snrpa1P57784 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Snrpa1P57784 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snrpa1P57784 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snrpa1P57784 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Snrpa1P57784 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Snrpa1P57784 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Snrpa1P57784 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.37
Snrpa1P57784 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Snrpa1P57784 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Snrpa1P57784 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Snrpa1P57784 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Snrpa1P57784 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Snrpa1P57784 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Snrpa1P57784 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Snrpa1P57784 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Snrpa1P57784 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Snrpa1P57784 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Snrpa1P57784 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Snrpa1P57784 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Snrpa1P57784 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Snrpa1P57784 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Snrpa1P57784 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Snrpa1P57784 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Snrpa1P57784 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Snrpa1P57784 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Snrpa1P57784 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Snrpa1P57784 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Snrpa1P57784 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Snrpa1P57784 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Snrpa1P57784 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Snrpa1P57784 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Snrpa1P57784 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Snrpa1P57784 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms