Protein–RNA interactions for Protein: P52875

Tmem165, Transmembrane protein 165, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem165P52875 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem165P52875 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmem165P52875 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem165P52875 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem165P52875 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem165P52875 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmem165P52875 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem165P52875 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem165P52875 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem165P52875 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem165P52875 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem165P52875 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem165P52875 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem165P52875 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem165P52875 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem165P52875 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem165P52875 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem165P52875 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem165P52875 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem165P52875 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem165P52875 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem165P52875 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem165P52875 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem165P52875 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem165P52875 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem165P52875 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem165P52875 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem165P52875 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem165P52875 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem165P52875 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem165P52875 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem165P52875 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem165P52875 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem165P52875 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem165P52875 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem165P52875 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem165P52875 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem165P52875 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem165P52875 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms