Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CcnfP51944 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CcnfP51944 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CcnfP51944 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CcnfP51944 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CcnfP51944 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CcnfP51944 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CcnfP51944 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CcnfP51944 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CcnfP51944 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CcnfP51944 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CcnfP51944 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CcnfP51944 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CcnfP51944 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CcnfP51944 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CcnfP51944 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CcnfP51944 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CcnfP51944 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CcnfP51944 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CcnfP51944 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CcnfP51944 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CcnfP51944 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CcnfP51944 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CcnfP51944 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CcnfP51944 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CcnfP51944 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CcnfP51944 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CcnfP51944 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcnfP51944 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcnfP51944 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcnfP51944 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcnfP51944 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcnfP51944 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CcnfP51944 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CcnfP51944 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CcnfP51944 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CcnfP51944 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CcnfP51944 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnfP51944 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CcnfP51944 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcnfP51944 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CcnfP51944 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcnfP51944 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CcnfP51944 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CcnfP51944 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcnfP51944 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcnfP51944 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcnfP51944 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CcnfP51944 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CcnfP51944 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcnfP51944 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcnfP51944 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcnfP51944 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CcnfP51944 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnfP51944 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnfP51944 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CcnfP51944 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CcnfP51944 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CcnfP51944 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CcnfP51944 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcnfP51944 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CcnfP51944 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CcnfP51944 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CcnfP51944 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CcnfP51944 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CcnfP51944 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CcnfP51944 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms