Protein–RNA interactions for Protein: P51942

Matn1, Cartilage matrix protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matn1P51942 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Matn1P51942 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Matn1P51942 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Matn1P51942 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Matn1P51942 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Matn1P51942 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Matn1P51942 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Matn1P51942 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Matn1P51942 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Matn1P51942 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Matn1P51942 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Matn1P51942 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Matn1P51942 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Matn1P51942 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Matn1P51942 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Matn1P51942 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Matn1P51942 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Matn1P51942 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Matn1P51942 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Matn1P51942 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Matn1P51942 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Matn1P51942 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Matn1P51942 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Matn1P51942 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Matn1P51942 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Matn1P51942 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Matn1P51942 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Matn1P51942 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Matn1P51942 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Matn1P51942 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Matn1P51942 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Matn1P51942 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Matn1P51942 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Matn1P51942 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Matn1P51942 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Matn1P51942 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Matn1P51942 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Matn1P51942 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Matn1P51942 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Matn1P51942 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Matn1P51942 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Matn1P51942 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Matn1P51942 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Matn1P51942 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Matn1P51942 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Matn1P51942 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Matn1P51942 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Matn1P51942 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Matn1P51942 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Matn1P51942 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Matn1P51942 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Matn1P51942 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Matn1P51942 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Matn1P51942 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Matn1P51942 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Matn1P51942 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Matn1P51942 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Matn1P51942 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Matn1P51942 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Matn1P51942 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Matn1P51942 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Matn1P51942 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms