Protein–RNA interactions for Protein: P50705

Defa7, Alpha-defensin 7, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa7P50705 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Defa7P50705 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Defa7P50705 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Defa7P50705 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa7P50705 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa7P50705 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa7P50705 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Defa7P50705 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Defa7P50705 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa7P50705 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa7P50705 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Defa7P50705 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Defa7P50705 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa7P50705 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Defa7P50705 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms