Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt6aP50446 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt6aP50446 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt6aP50446 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt6aP50446 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt6aP50446 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt6aP50446 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt6aP50446 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt6aP50446 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt6aP50446 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt6aP50446 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt6aP50446 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt6aP50446 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt6aP50446 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt6aP50446 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Krt6aP50446 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt6aP50446 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt6aP50446 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt6aP50446 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt6aP50446 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt6aP50446 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt6aP50446 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt6aP50446 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt6aP50446 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt6aP50446 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt6aP50446 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt6aP50446 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt6aP50446 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Krt6aP50446 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt6aP50446 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt6aP50446 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Krt6aP50446 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt6aP50446 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt6aP50446 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt6aP50446 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Krt6aP50446 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt6aP50446 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Krt6aP50446 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt6aP50446 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Krt6aP50446 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt6aP50446 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Krt6aP50446 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt6aP50446 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Krt6aP50446 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt6aP50446 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt6aP50446 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt6aP50446 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt6aP50446 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt6aP50446 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt6aP50446 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt6aP50446 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt6aP50446 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt6aP50446 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt6aP50446 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt6aP50446 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt6aP50446 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt6aP50446 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt6aP50446 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt6aP50446 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt6aP50446 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms