Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SftpbP50405 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SftpbP50405 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SftpbP50405 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SftpbP50405 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SftpbP50405 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SftpbP50405 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SftpbP50405 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SftpbP50405 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SftpbP50405 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SftpbP50405 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SftpbP50405 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SftpbP50405 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SftpbP50405 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SftpbP50405 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SftpbP50405 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SftpbP50405 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SftpbP50405 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SftpbP50405 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SftpbP50405 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SftpbP50405 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SftpbP50405 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SftpbP50405 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SftpbP50405 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SftpbP50405 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SftpbP50405 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SftpbP50405 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SftpbP50405 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SftpbP50405 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SftpbP50405 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SftpbP50405 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SftpbP50405 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SftpbP50405 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SftpbP50405 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SftpbP50405 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SftpbP50405 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SftpbP50405 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SftpbP50405 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SftpbP50405 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SftpbP50405 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SftpbP50405 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SftpbP50405 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SftpbP50405 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SftpbP50405 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SftpbP50405 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SftpbP50405 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SftpbP50405 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SftpbP50405 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SftpbP50405 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SftpbP50405 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SftpbP50405 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SftpbP50405 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SftpbP50405 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SftpbP50405 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SftpbP50405 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SftpbP50405 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SftpbP50405 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SftpbP50405 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SftpbP50405 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SftpbP50405 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SftpbP50405 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SftpbP50405 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SftpbP50405 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SftpbP50405 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SftpbP50405 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SftpbP50405 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SftpbP50405 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SftpbP50405 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SftpbP50405 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SftpbP50405 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SftpbP50405 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SftpbP50405 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SftpbP50405 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SftpbP50405 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SftpbP50405 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SftpbP50405 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SftpbP50405 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SftpbP50405 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SftpbP50405 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms