Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Epb42P49222 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb42P49222 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb42P49222 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Epb42P49222 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epb42P49222 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Epb42P49222 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Epb42P49222 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Epb42P49222 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Epb42P49222 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Epb42P49222 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Epb42P49222 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb42P49222 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb42P49222 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb42P49222 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Epb42P49222 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Epb42P49222 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Epb42P49222 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Epb42P49222 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Epb42P49222 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Epb42P49222 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Epb42P49222 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Epb42P49222 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Epb42P49222 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Epb42P49222 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Epb42P49222 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb42P49222 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Epb42P49222 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Epb42P49222 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Epb42P49222 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Epb42P49222 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Epb42P49222 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Epb42P49222 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Epb42P49222 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Epb42P49222 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Epb42P49222 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Epb42P49222 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Epb42P49222 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Epb42P49222 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Epb42P49222 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Epb42P49222 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Epb42P49222 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Epb42P49222 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Epb42P49222 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Epb42P49222 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Epb42P49222 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Epb42P49222 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epb42P49222 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epb42P49222 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epb42P49222 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epb42P49222 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Epb42P49222 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Epb42P49222 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Epb42P49222 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Epb42P49222 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Epb42P49222 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Epb42P49222 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Epb42P49222 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Epb42P49222 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Epb42P49222 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Epb42P49222 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Epb42P49222 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Epb42P49222 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Epb42P49222 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Epb42P49222 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Epb42P49222 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
Epb42P49222 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Epb42P49222 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Epb42P49222 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Epb42P49222 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Epb42P49222 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Epb42P49222 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Epb42P49222 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Epb42P49222 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Epb42P49222 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Epb42P49222 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Epb42P49222 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Epb42P49222 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Epb42P49222 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Epb42P49222 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Epb42P49222 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Epb42P49222 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Epb42P49222 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms