Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Epb41P48193 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Epb41P48193 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Epb41P48193 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Epb41P48193 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Epb41P48193 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Epb41P48193 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Epb41P48193 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Epb41P48193 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Epb41P48193 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epb41P48193 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Epb41P48193 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Epb41P48193 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epb41P48193 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epb41P48193 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epb41P48193 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41P48193 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41P48193 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41P48193 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41P48193 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41P48193 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Epb41P48193 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epb41P48193 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epb41P48193 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epb41P48193 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Epb41P48193 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Epb41P48193 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Epb41P48193 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Epb41P48193 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Epb41P48193 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Epb41P48193 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Epb41P48193 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Epb41P48193 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Epb41P48193 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Epb41P48193 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Epb41P48193 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Epb41P48193 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Epb41P48193 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epb41P48193 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Epb41P48193 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Epb41P48193 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Epb41P48193 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Epb41P48193 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epb41P48193 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epb41P48193 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epb41P48193 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epb41P48193 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Epb41P48193 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epb41P48193 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epb41P48193 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Epb41P48193 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Epb41P48193 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms