Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CratP47934 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CratP47934 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CratP47934 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CratP47934 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CratP47934 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CratP47934 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CratP47934 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CratP47934 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CratP47934 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CratP47934 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CratP47934 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CratP47934 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CratP47934 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CratP47934 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CratP47934 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CratP47934 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CratP47934 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CratP47934 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CratP47934 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CratP47934 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CratP47934 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CratP47934 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CratP47934 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CratP47934 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CratP47934 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CratP47934 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CratP47934 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CratP47934 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CratP47934 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CratP47934 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CratP47934 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CratP47934 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CratP47934 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CratP47934 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CratP47934 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CratP47934 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CratP47934 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CratP47934 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CratP47934 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CratP47934 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CratP47934 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CratP47934 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CratP47934 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CratP47934 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CratP47934 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CratP47934 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CratP47934 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CratP47934 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CratP47934 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CratP47934 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CratP47934 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CratP47934 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CratP47934 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CratP47934 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CratP47934 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CratP47934 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CratP47934 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CratP47934 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CratP47934 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CratP47934 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CratP47934 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CratP47934 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CratP47934 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CratP47934 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CratP47934 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CratP47934 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CratP47934 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CratP47934 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CratP47934 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CratP47934 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CratP47934 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CratP47934 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CratP47934 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CratP47934 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CratP47934 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CratP47934 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CratP47934 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CratP47934 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CratP47934 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CratP47934 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CratP47934 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CratP47934 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CratP47934 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CratP47934 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CratP47934 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CratP47934 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CratP47934 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CratP47934 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CratP47934 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CratP47934 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CratP47934 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CratP47934 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CratP47934 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CratP47934 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CratP47934 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CratP47934 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CratP47934 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CratP47934 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CratP47934 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms