Protein–RNA interactions for Protein: P47739

Aldh3a1, Aldehyde dehydrogenase, dimeric NADP-preferring, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh3a1P47739 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aldh3a1P47739 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aldh3a1P47739 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aldh3a1P47739 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aldh3a1P47739 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aldh3a1P47739 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Aldh3a1P47739 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh3a1P47739 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh3a1P47739 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh3a1P47739 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh3a1P47739 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh3a1P47739 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh3a1P47739 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh3a1P47739 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aldh3a1P47739 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aldh3a1P47739 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aldh3a1P47739 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh3a1P47739 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh3a1P47739 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh3a1P47739 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh3a1P47739 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh3a1P47739 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh3a1P47739 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh3a1P47739 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Aldh3a1P47739 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Aldh3a1P47739 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh3a1P47739 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Aldh3a1P47739 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aldh3a1P47739 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Aldh3a1P47739 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh3a1P47739 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh3a1P47739 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Aldh3a1P47739 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh3a1P47739 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Aldh3a1P47739 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh3a1P47739 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh3a1P47739 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Aldh3a1P47739 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Aldh3a1P47739 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Aldh3a1P47739 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Aldh3a1P47739 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Aldh3a1P47739 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Aldh3a1P47739 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aldh3a1P47739 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aldh3a1P47739 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Aldh3a1P47739 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aldh3a1P47739 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Aldh3a1P47739 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aldh3a1P47739 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Aldh3a1P47739 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Aldh3a1P47739 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aldh3a1P47739 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Aldh3a1P47739 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Aldh3a1P47739 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aldh3a1P47739 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aldh3a1P47739 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aldh3a1P47739 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Aldh3a1P47739 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aldh3a1P47739 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aldh3a1P47739 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aldh3a1P47739 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Aldh3a1P47739 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Aldh3a1P47739 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Aldh3a1P47739 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh3a1P47739 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Aldh3a1P47739 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh3a1P47739 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Aldh3a1P47739 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Aldh3a1P47739 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Aldh3a1P47739 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Aldh3a1P47739 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aldh3a1P47739 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aldh3a1P47739 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aldh3a1P47739 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Aldh3a1P47739 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Aldh3a1P47739 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aldh3a1P47739 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aldh3a1P47739 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aldh3a1P47739 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Aldh3a1P47739 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Aldh3a1P47739 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms