Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps4bP46467 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Vps4bP46467 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Vps4bP46467 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Vps4bP46467 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps4bP46467 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps4bP46467 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps4bP46467 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps4bP46467 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps4bP46467 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps4bP46467 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps4bP46467 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps4bP46467 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Vps4bP46467 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Vps4bP46467 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps4bP46467 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Vps4bP46467 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps4bP46467 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps4bP46467 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Vps4bP46467 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps4bP46467 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Vps4bP46467 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps4bP46467 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps4bP46467 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Vps4bP46467 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps4bP46467 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Vps4bP46467 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps4bP46467 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Vps4bP46467 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps4bP46467 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Vps4bP46467 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Vps4bP46467 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps4bP46467 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Vps4bP46467 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps4bP46467 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps4bP46467 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Vps4bP46467 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps4bP46467 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Vps4bP46467 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps4bP46467 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps4bP46467 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Vps4bP46467 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps4bP46467 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps4bP46467 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps4bP46467 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps4bP46467 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps4bP46467 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps4bP46467 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps4bP46467 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps4bP46467 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps4bP46467 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps4bP46467 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps4bP46467 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps4bP46467 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps4bP46467 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps4bP46467 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps4bP46467 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps4bP46467 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps4bP46467 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps4bP46467 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps4bP46467 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps4bP46467 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps4bP46467 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps4bP46467 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps4bP46467 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps4bP46467 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps4bP46467 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps4bP46467 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps4bP46467 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps4bP46467 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps4bP46467 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps4bP46467 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps4bP46467 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps4bP46467 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps4bP46467 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps4bP46467 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps4bP46467 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps4bP46467 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Vps4bP46467 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Vps4bP46467 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps4bP46467 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms