Protein–RNA interactions for Protein: P43688

Nkx2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-6P43688 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-6P43688 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-6P43688 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-6P43688 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nkx2-6P43688 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx2-6P43688 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx2-6P43688 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx2-6P43688 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nkx2-6P43688 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx2-6P43688 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nkx2-6P43688 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-6P43688 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nkx2-6P43688 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nkx2-6P43688 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nkx2-6P43688 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nkx2-6P43688 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Nkx2-6P43688 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nkx2-6P43688 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-6P43688 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-6P43688 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-6P43688 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nkx2-6P43688 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-6P43688 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-6P43688 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nkx2-6P43688 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nkx2-6P43688 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx2-6P43688 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx2-6P43688 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nkx2-6P43688 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nkx2-6P43688 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nkx2-6P43688 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-6P43688 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nkx2-6P43688 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-6P43688 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nkx2-6P43688 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx2-6P43688 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx2-6P43688 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nkx2-6P43688 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-6P43688 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-6P43688 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-6P43688 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nkx2-6P43688 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-6P43688 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-6P43688 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nkx2-6P43688 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nkx2-6P43688 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Nkx2-6P43688 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-6P43688 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nkx2-6P43688 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms