Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PtgfrP43117 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PtgfrP43117 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PtgfrP43117 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtgfrP43117 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtgfrP43117 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtgfrP43117 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtgfrP43117 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtgfrP43117 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtgfrP43117 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtgfrP43117 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
PtgfrP43117 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
PtgfrP43117 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PtgfrP43117 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtgfrP43117 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtgfrP43117 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtgfrP43117 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtgfrP43117 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtgfrP43117 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtgfrP43117 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PtgfrP43117 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
PtgfrP43117 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PtgfrP43117 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms