Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ighmbp2P40694 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ighmbp2P40694 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ighmbp2P40694 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ighmbp2P40694 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ighmbp2P40694 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ighmbp2P40694 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ighmbp2P40694 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ighmbp2P40694 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ighmbp2P40694 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ighmbp2P40694 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ighmbp2P40694 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ighmbp2P40694 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ighmbp2P40694 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ighmbp2P40694 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ighmbp2P40694 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ighmbp2P40694 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ighmbp2P40694 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ighmbp2P40694 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ighmbp2P40694 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ighmbp2P40694 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ighmbp2P40694 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ighmbp2P40694 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ighmbp2P40694 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ighmbp2P40694 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ighmbp2P40694 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ighmbp2P40694 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ighmbp2P40694 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ighmbp2P40694 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ighmbp2P40694 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ighmbp2P40694 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ighmbp2P40694 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ighmbp2P40694 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ighmbp2P40694 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ighmbp2P40694 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ighmbp2P40694 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ighmbp2P40694 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ighmbp2P40694 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ighmbp2P40694 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms