Protein–RNA interactions for Protein: P39038

Cdh4, Cadherin-4, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh4P39038 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh4P39038 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cdh4P39038 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cdh4P39038 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh4P39038 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cdh4P39038 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cdh4P39038 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cdh4P39038 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh4P39038 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh4P39038 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh4P39038 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh4P39038 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cdh4P39038 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cdh4P39038 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh4P39038 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cdh4P39038 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh4P39038 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh4P39038 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cdh4P39038 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh4P39038 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh4P39038 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh4P39038 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cdh4P39038 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh4P39038 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cdh4P39038 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh4P39038 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh4P39038 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdh4P39038 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh4P39038 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdh4P39038 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cdh4P39038 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh4P39038 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdh4P39038 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh4P39038 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdh4P39038 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh4P39038 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdh4P39038 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh4P39038 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh4P39038 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdh4P39038 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdh4P39038 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdh4P39038 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms