Protein–RNA interactions for Protein: P38649

Abo, Histo-blood group ABO system transferase, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AboP38649 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AboP38649 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AboP38649 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AboP38649 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AboP38649 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AboP38649 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AboP38649 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AboP38649 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AboP38649 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AboP38649 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AboP38649 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AboP38649 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AboP38649 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AboP38649 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AboP38649 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AboP38649 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AboP38649 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AboP38649 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AboP38649 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AboP38649 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AboP38649 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AboP38649 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AboP38649 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AboP38649 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AboP38649 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AboP38649 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AboP38649 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AboP38649 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AboP38649 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AboP38649 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
AboP38649 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AboP38649 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AboP38649 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AboP38649 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AboP38649 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AboP38649 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AboP38649 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AboP38649 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AboP38649 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AboP38649 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AboP38649 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AboP38649 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AboP38649 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AboP38649 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AboP38649 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AboP38649 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AboP38649 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AboP38649 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AboP38649 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AboP38649 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AboP38649 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AboP38649 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AboP38649 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AboP38649 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AboP38649 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AboP38649 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AboP38649 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
AboP38649 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AboP38649 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AboP38649 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AboP38649 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AboP38649 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AboP38649 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AboP38649 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AboP38649 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AboP38649 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AboP38649 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AboP38649 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AboP38649 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AboP38649 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AboP38649 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AboP38649 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AboP38649 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AboP38649 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AboP38649 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AboP38649 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AboP38649 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AboP38649 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AboP38649 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AboP38649 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AboP38649 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AboP38649 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AboP38649 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AboP38649 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AboP38649 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AboP38649 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AboP38649 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AboP38649 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AboP38649 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AboP38649 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AboP38649 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AboP38649 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
AboP38649 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
AboP38649 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AboP38649 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AboP38649 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AboP38649 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AboP38649 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AboP38649 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
AboP38649 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms